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論文ハイライト

大腸菌複数遺伝子欠損株を用いた解析による未知の代謝経路の発見

ゲノムスケールシミュレーションとフェノーム・メタボローム・トランスクリプトーム解析の組み合わせから新規代謝経路の発見へ Nakahigashi, K., Toya, Y., Ishii, N., Soga, T., Hasegawa, M., Watanabe, H., Takai, Y., Honma, M., Mori, H. and Tomita, M. Systematic phenome...

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毒性物質の代謝に関わる大腸菌新規代謝経路の発見と機能解明

酵素機能同定の新手法,メタボロームプロファイリングによる新発見 Saito, N., Robert, M., Koichi, H., Matsuo, G., Kakazu, Y., Soga, T. and Tomita, M. Metabolite profiling reveals YihU as a novel hydroxybutyrate dehydrogenase for altern...

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Chaos Game Representationによるゲノムのフラクタル解析

複雑系カオス理論を応用した新規ゲノム可視化手法を開発 Arakawa, K., Oshita, K. and Tomita, M. A web server for interactive and zoomable Chaos Game Representation images. Source Code Biol. Med.,4, 6.  「シェルピンスキーのギャスケット」や「コッホ曲線」で知...

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CE-TOFMSによる胃がんおよび大腸がん組織のメタボローム解析

がん組織における未知のエネルギー獲得機構の解明へ Hirayama, A., Kami, K., Sugimoto, M., Sugawara, M., Toki, N., Onozuka, H., Kinoshita, T., Saito, N., Ochiai, A., Tomita, M., Esumi, H. and Soga, T.Quantitative Metabolome Prof...

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シアノシステインによるタンパク質化学的切断法の開発と膜プロテオミクスへの応用

コンピュータ解析と実験科学の融合がもたらす、膜プロテオミクスへの大きな一歩 Iwasaki, M., Takeshi, M., Tomita, M., and Ishihama, Y. Chemical Cleavage-Assisted Tryptic Digestion for Membrane Proteome Analysis. J. Proteome Res., 8, 3169-3175...

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温泉に生息する古細菌から最大で3つに分断されているtRNA遺伝子を発見

Tri-split tRNAの発見からゲノム進化の道筋を探る Fujishima, K., Sugahara, J., Kikuta, K., Hirano, R., Sato, A., Tomita, M. and Kanai, A. Tri-split tRNA is a transfer RNA made from 3 transcripts that provides insight in...

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Genome Projector: Googleマップで直感的にゲノム情報をブラウジング

最新のインターネットアプリケーション開発技術を駆使して、広大なゲノム情報の世界を探索可能に Arakawa, K., Tamaki, S., Kono, N., Kido, N., Ikegami, K., Ogawa, R. and Tomita, M. Genome Projector: zoomable genome map with multiple views, BMC Bioinfor...

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超好熱性古細菌から見いだしたGTP依存性のRNA連結活性を有する新規酵素の解析

古細菌の断片化されたtRNAを連結する酵素を発見、新しいRNA連結メカニズムの存在を示唆 Kanai, A., Sato, A., Fukuda, Y., Okada, K., Matsuda, T., Sakamoto, T., Muto, Y., Yokoyama, S., Kawai, G. and Tomita, M., Characterization of a heat-stable ...

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網羅的なセンス-アンチセンス転写産物の発現解析

DNA遺伝子領域の重なりに込められた生命の謎にせまる Okada, Y., Tashiro, C., Numata, K., Watanabe, K., Nakaoka, H., Yamamoto, N., Okubo, K., Ikeda, R., Saito, R., Kanai, A., Abe, K., Tomita, M. and Kiyosawa, H. Comparative exp...

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ラット肝臓のアンモニア代謝シミュレーションモデル構築

多細胞生物を理解する方法論の確立を目指したバイオシミュレーションの応用 Ohno, H., Naito, Y., Nakajim, H., Tomita, M. Comstruction of at Biological Tissue Model based on a Single-Cell Model: A Computer Simulation of Metabolic Heterogenei...

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