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研究ハイライト

新規紫外線耐性菌株Arthrobacter sp. MN05-02のゲノム配列を決定

特徴的な色素産生遺伝子のパスウェイを明らかに Ii KM, Kono N, Paulino-Lima IG, Tomita M, Rothschild LJ, Arakawa K. Complete Genome Sequence of Arthrobacter sp. Strain MN05-02, a UV-Resistant Bacterium from a Manganese Deposi...

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個人の腸内では長期に渡って同一のビフィズス菌株が維持される可能性を示唆

10年間隔の全ゲノムシーケンスからビフィズス菌株の変化を調査 Tsukimi T., Watabe T., Tanaka K., Sato MP., Suzuki H., Tomita M., Fukuda S. (2020) Draft Genome Sequences of Bifidobacterium animalis Consecutively Isolated from Healt...

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強いクモ糸の人工合成を叶えるには何が必要か?

ヒトゲノムと同サイズのクモゲノムを解析することで見えた新たな因子 Kono N., Nakamura H., Ohtoshi R., Pedrazzoli Moran DA., Shinohara A., Yoshida Y., Fujiwara M., Mori M., Tomita M., Arakawa K. (2019) Orb-weaving spider Araneus ventric...

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コンピュータ・シミュレーションで明らかとなった、心筋細胞の代謝ダイナミクス

胎児に特有な心機能を維持するメカニズムを予測Sano, I., H., Toki, T., Naito, Y. and Tomita, M. (2017) Developmental changes in the balance of glycolytic ATP production and oxidative phosphorylation in ventricular cells: A si...

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斎藤輪太郎特任教授
斎藤輪太郎特任教授

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メタボロゲノミクス:腸内細菌と腸内代謝物の統合解析

食事による腸内環境変化の評価法を確立 Ishii C, Nakanishi Y, Murakami S, Nozu R, Ueno M, Hioki K, Aw W, Hirayama A, Soga T, Ito M, Tomita M, Fukuda S. A Metabologenomic Approach Reveals Changes in the Intestinal Enviro...

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複製プロセスがバクテリアのゲノム構造を決定していることを証明

時間の早送りによってゲノム上で塩基組成の偏りが発生するメカニズムを明らかに Kono N, Tomita M, Arakawa K. (2018) Accelerated laboratory evolution reveals the influence of replication on the GC skew in Escherichia coli. Genome Biol Evol. do...

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海藻に含まれる物質の大解剖

乾燥保存が海藻の水溶性代謝物質に与える影響を明らかにHamid, S.S., Wakayama, M., Soga, T. and M. Tomita. (2018) Drying and extraction effects on three edible brown seaweeds for metabolomics. J. Appl. Phycol. https://doi.org/10.1...

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ヒト免疫不全ウイルス (HIV) 進化の軌跡を俯瞰する

配列類似性ネットワークによるヒト免疫不全ウイルス(HIV) の分子進化解析 Nagata, S., Imai, J., Makino, G., Tomita, M., and Kanai, A. (2017). Evolutionary analysis of HIV-1 Pol proteins reveals representative residues for viral subtyp...

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周期的な配列を有するゲノム編集関連配列を検出する新規ソフトウェアを開発

大規模ゲノムデータからの周期的DNA/タンパク質配列の網羅的捕捉に成功 Mori, H., Evans-Yamamoto, D., Ishiguro, S., Tomita, M., and Yachie, N. (2019) Fast and global detection of periodic sequence repeats in large genomic resources. Nuc...

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