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研究ハイライト

遺伝子発現データから乳がん転移を予測する手法を開発

変数選択によって汎化性能を大幅に向上 Hikichi S, Sugimoto M. and Tomita M. (2020) Correlation-centred variable selection of a gene expression signature to predict breast cancer metastasis. Sci Rep. 10, 7923. doi: 10.103...

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LC-MS/MSとCE-MS/MSを併用したジペプチドの一斉分析法の開発

食品中の機能性成分や疾患バイオマーカーの探索に向けた新技術 Ozawa H, Hirayama A, Ishikawa T, Kudo R, Maruyama M, Shoji F, Doke T, Ishimoto T, Maruyama S, Soga T, Tomita M. Comprehensive dipeptide profiling and quantitation by ca...

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抗がん剤の効果を飛躍的に高めるタンパク質SLFN11の新機能を発見

大規模なクロマチンリモデリングによって「最初期遺伝子」の転写を制御 Murai J, Zhang H, Pongor L, Tang SW, Jo U, Moribe F, Ma Y, Tomita M, Pommier Y. Chromatin Remodeling and Immediate Early Gene Activation by SLFN11 in Response to Re...

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クマムシが住むコケの中のミクロな世界を覗きみる

メタバーコーディングで真核生物と細菌のコミュニティを網羅的に解析Arakawa K. Simultaneous Metabarcoding of Eukaryotes and Prokaryotes to Elucidate the Community Structures within Tardigrade Microhabitats. Diversity, 2020; 12(3):110. d...

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新規紫外線耐性菌株Arthrobacter sp. MN05-02のゲノム配列を決定

特徴的な色素産生遺伝子のパスウェイを明らかに Ii KM, Kono N, Paulino-Lima IG, Tomita M, Rothschild LJ, Arakawa K. Complete Genome Sequence of Arthrobacter sp. Strain MN05-02, a UV-Resistant Bacterium from a Manganese Deposi...

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個人の腸内では長期に渡って同一のビフィズス菌株が維持される可能性を示唆

10年間隔の全ゲノムシーケンスからビフィズス菌株の変化を調査 Tsukimi T., Watabe T., Tanaka K., Sato MP., Suzuki H., Tomita M., Fukuda S. (2020) Draft Genome Sequences of Bifidobacterium animalis Consecutively Isolated from Healt...

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強いクモ糸の人工合成を叶えるには何が必要か?

ヒトゲノムと同サイズのクモゲノムを解析することで見えた新たな因子 Kono N., Nakamura H., Ohtoshi R., Pedrazzoli Moran DA., Shinohara A., Yoshida Y., Fujiwara M., Mori M., Tomita M., Arakawa K. (2019) Orb-weaving spider Araneus ventric...

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コンピュータ・シミュレーションで明らかとなった、心筋細胞の代謝ダイナミクス

胎児に特有な心機能を維持するメカニズムを予測Sano, I., H., Toki, T., Naito, Y. and Tomita, M. (2017) Developmental changes in the balance of glycolytic ATP production and oxidative phosphorylation in ventricular cells: A si...

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斎藤輪太郎特任教授
斎藤輪太郎特任教授

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メタボロゲノミクス:腸内細菌と腸内代謝物の統合解析

食事による腸内環境変化の評価法を確立 Ishii C, Nakanishi Y, Murakami S, Nozu R, Ueno M, Hioki K, Aw W, Hirayama A, Soga T, Ito M, Tomita M, Fukuda S. A Metabologenomic Approach Reveals Changes in the Intestinal Enviro...

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