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心筋細胞の発生過程をたどる網羅的シミュレーション

胎生期の心臓を構成する心筋細胞の分化の機序をコンピュータで予測する Okubo, C., Sano, HI., Naito, Y., Tomita, M. (2013). Contribution of quantitative changes in individual ionic current systems to the embryonic development of ventricul...

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高度好熱菌界のモデル生物、Thermus thermophilus HB8が有する第3のプラスミドの発見

丁寧な実験によりゲノムプロジェクトで見落とされていた情報を明らかに Ohtani., N., Tomita, M. and Itaya, M. (2012) The third plasmid pVV8 from Thermus thermophilus HB8: isolation, characterization, and sequence determination. Extremophi...

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藻類がオイルを産生する仕組みを解析

メタボローム比較によって未知の代謝変化が明らかに Ito, T., Tanaka, M., Shinkawa, H., Nakada, T., Ano, Y., Kurano, N., Soga, T. and Tomita, M. (2013). Metabolic and morphological changes of an oil accumulating trebouxiophycea...

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リン酸化プロテオーム解析による抗癌剤ラパチニブの薬効評価

分子標的薬のシステムレベルでの作用機序を明らかに Imami, K., Sugiyama, N., Imamura, H., Wakabayashi, M., Tomita, M., Taniguchi, M., Ueno, T., Toi, M. and Ishihama, Y. (2012) Temporal profiling of lapatinib-suppressed phosphor...

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メタボローム解析による糖尿病性腎症の血清バイオマーカー探索

5種類の代謝物の組み合わせにより、腎症の発症を高精度に予測できる Hirayama, A., Nakashima, E., Sugimoto, M., Akiyama, S., Sato, W., Maruyama, S., Matsuo, S., Tomita, M., Yuzawa, Y. and Soga, T. (2012) Metabolic profiling reveals new ...

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システムの最適化が安定したメタボローム測定を可能に

シースレスCE-MS法によるメタボローム解析の高感度化 Hirayama, A., Tomita, M. and Soga, T. (2012) Sheathless capillary electrophoresis-mass spectrometry with a high- sensitivity porous sprayer for cationic metabolome analysis...

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ゲノム変異シミュレーションによるバクテリア複製終結機構の解明

コンピュータシミュレーションが解き明かすバクテリアゲノム進化の軌跡 Kono N, Arakawa K. and Tomita M. (2012). Validation of bacterial replication termination models using simulation of genomic mutations. PLoS One. 7(4): e34526.   ゲノム...

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大腸菌における低分子RNAのゲノムワイドな同定

ECSBrowser:世界初の大腸菌低分子RNAブラウザの開発 Shinhara, A., Matsui, M., Hiraoka, K., Nomura, W., Hirano, R., Nakahigashi, K., Tomita, M., Mori, H., Kanai, A. (2011) Deep sequencing reveals as-yet-undiscovered small...

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クロマチン構造とエピジェネティック制御の解明

バイオインフォマティクスによってヌクレオソームがゲノムに与える影響を解き明かす Nozaki T, Yachie N, Ogawa R, Kratz A, Saito R, Tomita M.(2011). Tight associations between transcription promoter type and epigenetic variation in histone posit...

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細胞の運命を決定する遺伝子群の発見

特定の低発現遺伝子郡のダイナミクスが好中球への分化を誘導 Tsuchiya M, Piras V, Guiliani A, Tomita M, Selvarajoo K. (2010). Collective dynamics of specific gene ensembles crucial for neutrophil differentiation: the existence of g...

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