論文/ハイライト論文ハイライト
08.06.23
リン酸化プロテオーム解析のための全自動濃縮・分析システムの開発
(08.06.23)
世界初、複雑極まる細胞抽出液の大規模リン酸化プロテオーム解析に成功
Imami, K., Sugiyama, N., Kyono, Y., Tomita, M. and Ishihama, Y. Automated Phosphoproteome Analysis for Cultured Cancer Cells by Two-Dimensional NanoLC-MS using a Calc...
09.04.13
バクテリアゲノムの複製による選択度合いを定量化
(09.04.13)
複製するメディアとして最適化されたゲノムのデザインパターンを探る
Arakawa, K. and Tomita, M. The GC skew index: a measure of genomic compositional asymmetry and the degree of replicational selection. Evolutionary Bioinformatics, 3, 1...
08.04.10
miRNAの遺伝子発現制御機能による抗ウイルス作用の解析
(08.04.10)
ヒトとウイルスの攻防戦、ヒト感染ウイルスにはヒトmiRNAが特異的に効く
Watanabe, Y., Kishi, A., Yachie, N., Kanai, A. and Tomita, M. (2007) Computational analysis of microRNA-mediated antiviral defense in humans. FEBS Letters 581(24) ...
08.04.10
ヒドロキシ酸/酸化金属を用いた高選択的リン酸化ペプチド濃縮法の開発
(08.04.10)
大規模な『リン酸化プロテオーム解析』に成功、がん細胞などに応用も
Sugiyama, N., Masuda, T., Shinoda, K., Nakamura, A., Tomita, M. and Ishihama, Y. (2007) Phosphopeptide Enrichment by Aliphatic Hydroxy Acid-modified Metal Oxide Chro...
08.04.10
微量ペプチド試料分析用の使い捨てマイクロデバイスの開発
(08.04.10)
ペプチドの精製、濃縮、分画または貯蔵に利用可能、数fmolの試料も定量的に回収
Rappsilber, J., Mann, M. and Ishihama, Y. Protocol for micro-purification, enrichment, pre-fractionation and storage of peptides for proteomics using StageTips....
08.04.10
機能が重複する遺伝子に関する進化モデルを提唱
(08.04.10)
300以上の原核生物ゲノムを比較解析することで遺伝子の進化がみえてきた Kochiwa, H., Tomita, M. and Kanai, A. Evolution of ribonuclease H genes in prokaryotes to avoid inheritance of redundant genes. BMC Evolutionary Biology 7(1) 128
...
08.04.10
メタボローム解析技術を利用した酵素機能解析手法の開発
(08.04.10)
あらゆる生物に応用可能。酵素を選り分け機能を探り、代謝の全体図を解き明かす
Saito, N., Robert, M., Kitamura, S., Baran, R., Soga, T., Mori, H., Nishioka, T. and Tomita, M. (2006) Metabolomics approach for enzyme discovery. J. Proteome Res...
08.04.10
CE-TOFMSを用いたメタボローム測定によるバイオマーカーの探索
(08.04.10)
わずか20分で全代謝物質量を測定、急性肝炎の判定など医療への応用も期待
Soga, T., Baran, R., Suematsu, M., Ueno, Y., Ikeda, S., Sakurakawa, T., Kakazu, Y., Ishikawa, T., Robert, M., Nishioka, T. and Tomita, M. (2006) Differential metabo...
08.04.10
超好熱性古細菌におけるDNA/RNA結合タンパク質の網羅的予測と同定
(08.04.10)
アミノ酸配列に潜んだ周期性を指標に、知られざるセントラルドグマの担い手を見つけ出す Fujishima, K., Komasa, M., Kitamura, S., Suzuki, H., Tomita , M and Kanai, A. (2007) Proteome-Wide Prediction of Novel DNA/RNA-Binding Proteins Using Amino Ac...
08.02.04
動的／静的ハイブリッドアルゴリズム適用に向けた酵素分類手法の開発
(08.02.04)
メタボロームデータとモデリング手法の融合を果たし、夢の全代謝シミュレーションへ近づく
Ishii, N., Nakayama, Y. and Tomita, M. (2007) Distinguishing enzymes using metabolome data for the hybrid dynamic/static method., Theoretical Biology and Med...